La concentration s'exprime en millions/millilitre. La valeur de référence définie par l'Organisation Mondiale de la Santé (OMS) est de 20 millions/ml.

Il est important de savoir que la concentration de spermatozoïdes peut varier chez un même individu de manière importante.

Les facteurs qui peuvent agir sur la concentration sont la durée d'abstinence, le stress, l'absorption excessive d'alcool, la prise de certains médicaments et drogues (comme la marijuana), les traumatismes physiques, etc...

Lorsque l'éjaculat ne contient pas de spermatozoïdes, on parle alors d'azoospermie et des examens complémentaires sont nécessaires pour en déterminer l'origine.

• On parle d'azoospermie sécrétoire, lorsque l'absence de spermatozoïdes est due à un défaut de fabrication. Cette situation s'observe suite à des traitements anticancéreux (chimiothérapie, radiothérapie), à des maladies (oreillons de l'adulte), ainsi que chez des individus porteurs d'un défaut génétique (syndrome de Klinefelter 47XXY).
• On parle d'azoospermie excrétoire, lorsque les canaux reliant les testicules à la prostate sont absents (agénésie des canaux déférents), obstrués (suite par exemple à une infection), ou interrompus (après une vasectomie).